غار يخگان در 77 کیلومتری شهر خلخال در ضلع غربی رشته کوه ماسوله داغ (تالش) و در ارتفاع حدود 2400 متری از سطح دريا در دامنه غربی كوهی به نام يخگان داغی (بوزخانه داغی) واقع شده است. مساحت این غار 1100 هکتار می‌باشد و دارای دو دهانه است که با اختلاف ارتفاع حدود 25 كيلومتر از یکدیگر قرار دارند. قطر دهانه ورودی اصلی این غار در حدود نیم متر است که به وسیله راهرویی تنگ و باریک به طول 10 متر، به تالار وسیعی منتهی می‌شود. حوضچه آبی به عمق 20 سانتی‌متر و در ارتفاع 1 و نیم متری در كف غار تشكيل شده است.