موزه آستان مقدس حضرت شاهچراغ ع در تاریخ 30 آبان 1344 هجری شمسی در صحن بارگاه شاهچراغ شیراز افتتاح شد و در طی سال های متمادی آثار اهدایی به موزه افزایش یافت پس از انقلاب اسلامی مسئولان مجموعه تصمیم گرفتند تا کتابخانه آستان مقدس را که در قسمت بالایی موزه قرار داشت به موزه اضافه و آن را بزرگ تر کنند پس از آن فضای موزه بزرگ تر و طراحی داخلی آن تغییراتی کرد آثار اهدایی به این موزه دارای تنوع بسیار بالایی دارد و طیف گسترده ای از اشیای دوران تاریخی مختلف از باستان تا دوران اسلامی مانند نسخ خطی فلزکاری های نفیس قرآن اسناد قدیمی شیشه سفال در این موزه قابل بازدید است آثار موجود در موزه به طور کلی بالغ بر 8 هزار شی و بیش از 3 هزار نسخه خطی و سند قدیمی است که پس از طی مراحل تخصصی به صورت گردشی به نمایش در می آیند و زائران و گردشگران می توانند از آن ها دیدن کنند