قسمتی از فهرست کتابخانه شیخ صفی الدین:1. مطلع خصوص الکلم فی معانی فصوص الحکم. بزبان عربی در فلسفه اسلامی، تألیف محمد بن علی.2. اسماء الحسنی، با ترجمه عربی تألیف سلطانعلی مشهدی.3. اسناد مناجات مخمس بعربی.4. صحیفه کامله، تألیف عبد اللّه بن عمر بعربی.5. طوالع الانوار و مطالع الانظار بعربی. تألیف بیضاوی.6. شواکل الحور فی شرح هیاکل النور.7. الاشارات و التنبیهات.8. کتاب الکناش معروف بکتاب الفاخر. تألیف محمد بن زکریای رازی در طب.9. الجامع الکبیر معروف بالحاوی. تألیف یحیی بن سعید هذلی حلی.10. مرقعات. 11. روضه عین القضاة همدانی.12. کتاب علم. تألیف غزالی.13. لوایح جامی.14. تحفه شاهی.15. مقاله خواجه انصاری.16. کیمیا.17. سعادت غزالی.18. تاریخ طبری بفارسی. 19. فردوس التواریخ.20. روضة الصفا میرخواند در 11 جلد.21. خلاصة الاخبار فی بیان الاحوال الاخیار، تألیف خواندمیر.22. حبیب السیر.23. جواهر الاخبار بوداق.24. جامع التواریخ رشید الدین.25. ظفرنامه تیموری.26. مطلع السعدین و مجمع البحرین عبد الرزان سمرقندی.27. مطلع السعدین مذکور.28. بیاض مکالمه شاه طهماسب با ایلچیان.29. صفوة الصفای ابن البزاز.30. تاریخ شرفنامه.31. تاریخ الدائر کالدرر و الجواهر.32. روضة الجنات فی سیرة النبی و الآل و الاصحاب.33. مجمع الانساب.34. احسن الکبار فی معرفة الائمة الاطهار تألیف محمد بن زید بن عربشاه حسینی.35. احسن الکبار جلد دوم.36. خلاصة الاشعار و زبدة الافکار.37. مجموعه شعرا.38. خمسه نظامی.39. دیوان اشعار.40. شاهنامه 4 نسخه.41. دیوان انوری.42. دیوان جامی.43. دیوان اشعار متفرقه (متعدد).44. خسرو و شیرین.45. انتخاب حدیقه حکیم سنائی.46. دیوان خاقانی.47. دیوان صفی.48. دیوان عطار.49. دیوان کمال الدین مکرر.50. گلستان سعدی.51. کلمات.52. نظامی گنجوی.53. انتخاب دیوان خسرو.54.گلشن راز.55. کلیات دهلوی.56. انتخاب دیوان خسرو.57. هشت بهشت.58. لیلی و مجنون.59. انتخاب خسرو شیرین.60. خسرو خان وریرانی.61. ترجیع‌بند جامی.62. دیوان امیر حسین دهلوی.63. زاد المسافرین.64. دیوان خواجه.65. دیوان ابن یمین.66. کتاب مهر و تستری تألیف عصار (متعدد).67. کلیات عماد الملة و الدین فقیه کرمانی (متعدد).68. دیوان حافظ شیرازی.69. کلیات حکیم نزاری.70. دیوان کاتبی.71. غزلیات شاهی در سه نسخه.72. کتب سبعه جامی.73. تحفة الاحرار در سه مجلد (شعر).74. سبعة الاحرار (شعر).75. سلسلة الذهب اشعار فارسی.76. چهل حدیث جامی.77. دیوان اشعار.76. گوی و چوگان شیخ سعدی.77. ثمرنامه هاتفی- جامی نسخ متعدده.78. شاهنامه هاتفی.79. منظر نظامی.80. مرثیه.81. دیوان بابا افغانی.82. آصفی.83. رساله ملا سلطانعلی.84. قصاید و اشعار.85. آثار المظفر.86. شاهنامه شاه اسماعیل.87. شاه درویش هلالی.88. کلیات اهلی شیرازی.89. کلیات اهلی شیرازی (مکرر).90. عقاید شاهی.91. کتاب مهر.92. عماد فقیه.93. دیوان مانی.94. حسن و دل.95. نزهة العاشقین.96. مرزبان نامه.97. ترجمة الفرج بعد الشدة. 98. مرقعات و دواوین مختلفه.99. نظم و نثر ترکی.100. کلیات نوائی.101. خمسه علیشیر نوائی.102. دیوان نوائی (متعدد).103. اسکندرنامه.